Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cldn34b2Q9D9N2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms