Protein–RNA interactions for Protein: Q9D958

Spcs1, Signal peptidase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spcs1Q9D958 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spcs1Q9D958 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Spcs1Q9D958 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms