Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tmigd1Q9D7L8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Tmigd1Q9D7L8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms