Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Capns2Q9D7J7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms