Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9D7E4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9D7E4 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9D7E4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Q9D7E4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 280.2 ms