Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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PudpQ9D5U5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
PudpQ9D5U5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
PudpQ9D5U5 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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