Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lonrf3Q9D4H7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms