Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Mrpl53Q9D1H8 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Mrpl53Q9D1H8 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Mrpl53Q9D1H8 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
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Mrpl53Q9D1H8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Mrpl53Q9D1H8 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Mrpl53Q9D1H8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
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Mrpl53Q9D1H8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Mrpl53Q9D1H8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
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