Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Mrpl28Q9D1B9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms