Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Susd3Q9D176 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Susd3Q9D176 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms