Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms