Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rfc5Q9D0F6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms