Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gtf2e1Q9D0D5 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gtf2e1Q9D0D5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms