Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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