Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mis12Q9CY25 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms