Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Malsu1Q9CWV0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms