Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ccer1Q9CQL2 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccer1Q9CQL2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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