Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufb9Q9CQJ8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ndufb9Q9CQJ8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms