Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms