Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Q9CQC3 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Q9CQC3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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