Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
1700029P11RikQ9CQ68 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
1700029P11RikQ9CQ68 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms