Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nsmce3Q9CPR8 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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