Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Mrpl43Q99N89 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Mrpl43Q99N89 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms