Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ms4a6dQ99N07 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms