Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Ms4a4dQ99N05 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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Ms4a4dQ99N05 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
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