Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp16Q99LG0 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms