Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pagr1aQ99L02 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Pagr1aQ99L02 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms