Protein–RNA interactions for Protein: Q99KE3

Dok4, Docking protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok4Q99KE3 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Dok4Q99KE3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms