Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pacsin3Q99JB8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms