Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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CsprsQ99388 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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CsprsQ99388 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CsprsQ99388 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms