Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 L1cam-203ENSMUST00000114430 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Zfp827-202ENSMUST00000098614 7581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Ryr1-208ENSMUST00000214374 15300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
SptssbQ925E8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms