Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Csmd1Q923L3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Rgs6-207ENSMUST00000186323 1308 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Csmd1Q923L3 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms