Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim59Q922Y2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms