Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Dkk4Q8VEJ3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms