Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE99

Ccdc115, Coiled-coil domain-containing protein 115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc115Q8VE99 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc115Q8VE99 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc115Q8VE99 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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