Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Smg8Q8VE18 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms