Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Stx18Q8VDS8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms