Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9Q8VC31 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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