Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ApobrQ8VBT6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ApobrQ8VBT6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms