Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim29Q8R2Q0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms