Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc12Q8K5B8 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Hoxc12Q8K5B8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms