Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Prpf39Q8K2Z2 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
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Prpf39Q8K2Z2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Prpf39Q8K2Z2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Prpf39Q8K2Z2 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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