Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Trappc12Q8K2L8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Trappc12Q8K2L8 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Trappc12Q8K2L8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Trappc12Q8K2L8 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trappc12Q8K2L8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trappc12Q8K2L8 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trappc12Q8K2L8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trappc12Q8K2L8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trappc12Q8K2L8 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trappc12Q8K2L8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trappc12Q8K2L8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trappc12Q8K2L8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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