Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ufl1Q8CCJ3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms