Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB62

Cntrob, Centrobin, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntrobQ8CB62 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CntrobQ8CB62 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
CntrobQ8CB62 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms