Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q8C708 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Q8C708 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Q8C708 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms