Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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