Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trim35Q8C006 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Psph-202ENSMUST00000118268 785 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm15780-201ENSMUST00000121283 935 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Zfp978-202ENSMUST00000154154 1250 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 6030442E23Rik-201ENSMUST00000186618 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm44717-201ENSMUST00000208133 578 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 AC113031.2-201ENSMUST00000226132 579 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 AC102603.1-201ENSMUST00000227481 584 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Olfr617-201ENSMUST00000048265 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Spink10-201ENSMUST00000055725 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 C030006N10Rik-201ENSMUST00000219077 517 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Trim35Q8C006 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Olfr988-201ENSMUST00000099928 1076 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm14308-203ENSMUST00000119149 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm14434-202ENSMUST00000120959 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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