Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

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Length 1,371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssc5dQ8BV57 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ssc5dQ8BV57 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ssc5dQ8BV57 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Ssc5dQ8BV57 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Ssc5dQ8BV57 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ssc5dQ8BV57 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Ssc5dQ8BV57 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms