Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc172Q810N9 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc172Q810N9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms